Operativne funkcije sprovodi Stub Misije za operativnu podršku, koji zadržava ograničene rezidualne kapacitete kao druga instanca za bezbednosni odgovor i pruža podršku operativnom razvoju Policije Kosova za kontrolu mase i nemira. Konkretno, EULEX-ova Specijalizovana policijska jedinica (SPJ), koju čini 105 poljskih policajaca, druga je instanca za bezbednosni odgovor na Kosovu, kao deo troslojnog mehanizma za bezbednosne intervencije, u okviru kojeg je Policija Kosova prva instanca za bezbednosni odgovor, EULEX druga, a KFOR treća instanca za bezbednosni odgovor. U svojoj ulozi druge instance za bezbednosni odgovor, EULEX-ova SPJ može da se angažuje samo na izričit zahtev prve instance za bezbednosni odgovor, kako bi doprinela održavanju i unapređenju javnog reda i bezbednosti u slučajevima građanskih nemira. U svrhu spoznaje situacije, SPJ sprovodi mobilne izviđačke patrole 24/7, radeći u smenama. SPJ redovno učestvuje u vežbama kontrole masa i nemira zajedno sa Policijom Kosova i KFOR-om. Od 15. juna 2018. do 14. juna 2023. godine, SPJ je učestvovala u deset zajedničkih obuka sa Policijom Kosova i KFOR-om, 11 obuka sa Policijom Kosova i 70 obuka sa KFOR-om. Cilj tih obuka je da se osigura nesmetana koordinacija između tri instance za bezbednosni odgovor u slučaju raspoređivanja u stvarnim situacijama.
EULEX takođe pruža podršku Policiji Kosova na polju međunarodne policijske saradnje, olakšavajući razmenu informacija između Policije Kosova i Interpola, Europola ili srpskog Ministarstva unutrašnjih poslova. Od 15. juna 2018. do 14. juna 2023. godine EULEX je primio i podneo 1695 zahteva koji se odnose na razmenu informacija između Europola i Policije Kosova i 2731 zahtev u vezi sa razmenom informacija između Policije Kosova i Ministarstva unutrašnjih poslova Srbije u skladu sa protokolom o policijskoj saradnji dva entiteta. Misija takođe olakšava razmenu informacija između Nacionalnih centralnih biroa Interpola i Jedinice Policije Kosova za međunarodnu koordinaciju u oblasti sprovođenja zakona pod okriljem Interpolove Kancelarije za vezu u UNMIK-u. Od 15. juna 2018. do 14. juna 2023. godine osoblje EULEX-a koje radi u UNMIK Kancelariji za vezu sa Interpolom primilo je i podnelo 10130 zahteva.
Pored toga, Misija nastavlja da upravlja svojim sopstvenim programom zaštite svedoka.
EULEX-ovi stručnjaci nastavljaju da rade zajedno sa svojim lokalnim kolegama na Institutu za sudsku medicinu na utvrđivanju sudbine nestalih lica, pružajući ekspertizu i savete u pogledu identifikacije potencijalnih skrivenih grobova i ekshumacije i identifikacije žrtava u vezi sa sukobom na Kosovu. Od početka EULEX-ovog mandata do 14. juna 2023. godine, EULEX je sproveo736 terenskih operacija za pronalaženje nestalih lica, uključujući 198 ekshumacija. Identifikovani su posmrtni ostaci 491 lica, uključujući 339 nestalih lica. Pored toga, stručnjaci EULEX-a rade zajedno sa kosovskim vlastima na rešavanju pitanja posmrtnih ostataka u prištinskoj mrtvačnici.
Misija takođe pomaže Specijalizovanim većima Kosova i Specijalizovanom tužilaštvu Kosova, pružajući logističku i operativnu podršku u skladu sa relevantnim kosovskim zakonodavstvom.